Kromosom 6
Kromosom 6 adalah salah satu dari 23 pasang kromosom pada manusia. Seorang manusia biasanya memiliki dua salinan kromosom ini. Kromosom 6 mencakup lebih dari 170 juta pasangan basa (bahan pembangun DNA) dan mewakili antara 5,5 hingga 6% dari total DNA dalam sel. Kromosom 6 berisi kompleks histokompatibilitas utama yang terdiri dari 100 gen lebih yang terkait dengan respons imun (respons kolektif dan terkoordinasi dari sistem imun tubuh terhadap pengenalan zat asing) dan berperan penting dalam transplantasi organ.
Satu dari ibu, satu dari ayah.
Gen
Antigen leukosit manusia berada di kromosom 6, dengan pengecualian untuk gen β2-mikroglobulin yang terletak di kromosom 15, dan mengodekan permukaan sel antigen guna menyajikan protein selain fungsi-fungsi lainnya.
Jumlah gen
Pada 2003, keseluruhan kromosom 6 dianotasi secara manual untuk protein, menghasilkan identifikasi 1.557 gen dan 633 pseudogen.[1]
Berikut ini adalah beberapa perkiraan jumlah gen yang lebih baru. Karena para peneliti menggunakan pendekatan berbeda untuk penjelasan genom, maka prediksi mereka tentang jumlah gen pada setiap kromosom berbeda-beda (untuk perincian teknis, lihat prediksi gen). Proyek urutan pengodean konsensus kolaboratif yang dilakukan oleh CCDS menggunakan strategi yang sangat konservatif. Sehingga prediksi jumlah gen CCDS menunjukkan batas yang lebih rendah pada jumlah total gen pengode protein manusia.[2]
| Diperkirakan oleh | Gen pengodean protein | Gen RNA non-pengodean | Pseudogen | Sumber | Tanggal |
|---|---|---|---|---|---|
| CCDS | 996 | — | — | [3] | 2016-09-08 |
| HGNC | 1,007 | 422 | 736 | [4] | 2017-05-12 |
| Ensembl | 1,038 | 985 | 800 | [5] | 2017-03-29 |
| UniProt | 1,111 | — | — | [6] | 2018-02-28 |
| NCBI | 1,053 | 1,188 | 911 | [7][8][9] | 2017-05-19 |
Referensi
- ^ Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, Edwards CA, Ashurst JL, Wilming L, et al. (October 2003). "The DNA sequence and analysis of human chromosome 6". Nature. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Natur.425..805M. doi:10.1038/nature02055
. PMID 14574404.
- ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). "Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes". Genome Biol. 11 (5): 206. doi:10.1186/gb-2010-11-5-206. PMC 2898077 . PMID 20441615.
- ^ "Search results - 6[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. CCDS Release 20 for Homo sapiens. 2016-09-08. Diakses tanggal 2017-05-28.
- ^ "Statistics & Downloads for chromosome 6". HUGO Gene Nomenclature Committee. 2017-05-12. Diakses tanggal 2017-05-19.
- ^ "Chromosome 6: Chromosome summary - Homo sapiens". Ensembl Release 88. 2017-03-29. Diakses tanggal 2017-05-19.
- ^ "Human chromosome 6: entries, gene names and cross-references to MIM". UniProt. 2018-02-28. Diakses tanggal 2018-03-16.
- ^ "Search results - 6[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.
- ^ "Search results - 6[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ( ("genetype miscrna"[Properties] OR "genetype ncrna"[Properties] OR "genetype rrna"[Properties] OR "genetype trna"[Properties] OR "genetype scrna"[Properties] OR "genetype snrna"[Properties] OR "genetype snorna"[Properties]) NOT "genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.
- ^ "Search results - 6[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype pseudo"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.
 | Artikel bertopik biologi ini adalah sebuah rintisan. Anda dapat membantu Wikipedia dengan mengembangkannya. |