Suzuki Shogun 125 adalah Shogun generasi ketiga yang diluncurkan pada tahun 2004 oleh PT. Suzuki Indomobil Sales. Dengan meningkatkan kapasitas mesin dari 110cc menjadi 125cc, dan untuk kelas 110cc di gantikan Suzuki Smash 110. Suzuki Shogun 125 dilengkapi dengan berbagai fitur seperti kunci kontak magnet dan bagasi extra luas.
Dan tidak lama kemudian tahun 2005 Suzuki mengeluarkan Shogun Sport Production (SP) dengan velg CW, Rem Cakram super lebar di bagian depan dan rem cakram di bagian belakang. Dan Shogun SP juga di bekali kopling manual untuk menambah akselerasi awal. Dan Suzuki Shogun 125 juga telah di uji cobakan dalam Suzuki Jelajah Negeri 2 dan Uji ketahanan 48 Jam nonstop.
Suzuki Shogun 125 mendapat update signifikan di tahun 2007 silam. Update yang dapat terlihat adalah perbaikan di sektor desain yang lebih sporty, sein berpindah ke tebeng depan, plus perbaikan di sektor mesin berupa penambahan Throttle Positioning Sensor, dan Engine Balancer, yang membuat Mesinnya lebih minim vibrasi. Shogun 125 dijual dalam beberapa Varian, Seperti Shogun 125 (Standar), Shogun 125 RR (CW - Non Kopling Manual), Shogun 125 SP (CW - Kopling Manual), Shogun F1 (Fuel-Injeksi) & Shogun 125 NR (Edisi Spesial Night Rider).
