Daftar Presiden Sudan Selatan

(Tanggal dalam huruf miring menandakan yang bersangkutan de facto melanjutkan jabatannya)

Periode Jabatan	Pejabat	Catatan
9 Juli 2005 - 30 Juli 2005	John Garang de Mabior, Presiden Pemerintahan Sudan Selatan	Meninggal pada 30 Juli 2005 dalam kecelakaan pesawat terbang.
30 Juli 2005 - 11 Agustus 2005	Salva Kiir Mayardit, Presiden Pemerintahan Sudan Selatan (sementara)
11 Agustus 2005 - Sekarang	Salva Kiir Mayardit, Presiden Pemerintahan Sudan Selatan

Catatan: Presiden Sudan Selatan juga menjabat sebagai Wakil Presiden Sudan dalam pemerintahan nasional.