Basa nukleotida
Basa nukleotida (atau nukleobasa) merujuk pada bagian pada DNA dan RNA yang dapat terlibat dalam pemasangan basa (lihat pula pasangan basa), utamanya adalah sitosina, guanina, adenina (DNA dan RNA), timina (DNA) dan urasil (RNA), secara berurutan disingkat C, G, A, T, dan U. Dalam genetika, basa nukleotida tersebut biasanya hanya disebut sebagai basa. Karena A, G, C, dan T muncul pada DNA, molekul-molekul ini dsebut basa DNA, sedangkan A, G, C, dan U disebut basa RNA.
Urasil menggantikan timina pada RNA. Kedua basa ini identik terkecuali bahwa urasil kekurangan gugus 5' metil. Adenina dan guanina merupakan kelas molekul bercincin dua yang disebut purina (disingkat sebagai R). Sitosina, timina, dan urasil semuanya merupakan pirimidina (disingkat Y).
Basa yang secara kovalen berikatan dengan karbon 1' ribosa atau deoksiribosa disebut sebagai nukleosida, dan nukleosida yang memiliki gugus fosfat pada karbon 5' disebut sebagai nukleotida.
Selain adenosina (A), sitidina (C), guanosina (G), timidina (T) dan uridina (U), DNA dan RNA juga mengandung basa-basa yang telah dimodifikasi setelah rantai asam nukelat terbentuk. Pada DNA, basa satu-satunya yang dimodifikasi adalah 5-metilsitidina (m5C). Pada RNA, terdapat banyak basa yang dimodifikasi, meliputi pseudouridina (Ψ), dihidrouridina (D), inosina (I), ribotimidina (rT) dan 7-metilguanosina (m7G).[1][2]
Hipoxantina dan xantina merupakan salah satu basa yang terbentuk oleh keberadaan mutagen. Keduanya terbentuk melalui proses deaminasi. Hipoxantina dihasilkan dari adenina, dan xantina dari guanina.[3] Dengan cara yang sama, deaminasi sitosina menghasilkan urasil.
Struktur
- Struktur kerangka adenina dan guanina merupakan purina, sehingga ia dinamakan basa purina.
- Struktur kerangka sitosina, urasil, dan timina merupakan pirimidina, sehingga dinamakan basa pirimidina.
Basa utama
Basa-basa berikut terlibat dalam pemanjangan rantai selama sintesis RNA atau DNA.
Basa nukleotida |
Adenina |
Guanina |
Timina |
Sitosina |
Uracil |
Nukleosida |
Struktur kimia adenosina Adenosina A |
Guanosina G |
Timidina T |
Sitidina C |
Uridina U |
Basa purina yang dimodifikasi
Contoh-contoh adenosina dan guanosina yang dimodifikasi.
Basa pirimidina yang dimodifikasi
Contoh-contoh sitidina, timidina, dan uridina yang dimodifikasi.
Basa nukleotida |
Urasil |
5,6-Dihidrourasil |
5-Metilsitosina |
Nucleosida |
Struktur kimia pseudouridina Pseudouridina Ψ |
Struktur kimia of dihidrouridina Dihidrouridina D |
5-Metilsitidina m5C |
Referensi
- ^ BIOL2060: Translation
- ^ Research
- ^ T Nguyen, D Brunson, C L Crespi, B W Penman, J S Wishnok, and S R Tannenbaum, DNA damage and mutation in human cells exposed to nitric oxide in vitro, Proc Natl Acad Sci U S A. 1992 April 1; 89(7): 3030–3034