Babak kualifikasi untuk Piala UEFA 2005–2006 dimulai pada 14 Juli 2005. Secara total, ada dua babak kualifikasi yang mempersempit klub menjadi 80 tim dalam persiapan untuk babak pertama.

Babak Kualifikasi Pertama

Tim 1 Agregat Tim 2 Leg 1 Leg 2
Wilayah Selatan-Mediterania
Baskimi   4–1   Žepče 3–0 1–1
Birkirkara   0–6   APOEL 0–2 0–4
Sant Julià   0–10   Rapid București 0–5 0–5
Teuta   3–4   Široki Brijeg 3–1 0–3
Elbasani   1–1 (a)   Vardar 1–1 0–0
Omonia   6–0   Hibernians 3–0 3–0
Domagnano   0–8   NK Domžale 0–5 0–3
Wilayah Timur Tengah
Ferencvárosi TC   2–3   MTZ-RIPO Minsk 0–2 2–1
Banants   4–3   Locomotive Tbilisi 2–3 2–0
Torpedo Kutaisi   0–6   BATE Borisov 0–1 0–5
Vaduz   2–1   Dacia Chişinău 2–0 0–1
Baku   2–3   MŠK Žilina 1–0 1–3
Mainz 05   4–0   MIKA 4–0 0–0
Nistru Otaci   5–2   Khazar Lenkoran 3–1 2–1
Wilayah Utara
Longford Town   3–5   Carmarthen Town 2–0 1–5
Ekranas   1–2   Cork City 0–2 1–0
ÍBV Vestmannaeyjar   2–3   B36 Tórshavn 1–1 1–2
AC Allianssi   4–1   CS Pétange 3–0 1–1
Linfield   2–2 (a)   Ventspils 1–0 1–2
NSÍ Runavík   0–6   FHK Liepājas Metalurgs 0–3 0–3
Etzella Ettelbruck   0–6   Keflavik ÍF 0–4 0–2
Portadown   1–3   Viking 1–2 0–1
TVMK   1–2   MyPa 1–1 0–1
Rhyl   4–4 (a)   Atlantas 2–1 2–3
Esbjerg   7–2   Flora 1–2 6–0


Pranala Luar