Daftar perguruan tinggi swasta di Papua Pegunungan

Berikut adalah Daftar perguruan tinggi swasta di Papua Pegunungan, yang pembinaannya berada di bawah Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia dan Perguruan Tinggi Swasta Keagamaan, yang pembinaannya berada di bawah Kementerian Agama. Daftar ini tidak termasuk Perguruan Tinggi Kedinasan yang pembinaannya berada dibawah masing-masing kementerian/lembaga.

Universitas

• Universitas Amal Ilmiah Yapis Wamena, Jayawijaya
• Universitas Okmin Papua, Pegunungan Bintang

Sekolah Tinggi

• Sekolah Tinggi Ilmu Manajemen Informatika dan Teknik Komputer Agamua Wamena, Jayawijaya
• Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Petra Baliem Wamena, Jayawijaya
• Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan Abdi Wacana Wamena, Jayawijaya
• Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan Kristen Wamena, Jayawijaya

Akademi

• Akademi Bahasa Asing Netaiken Wamena, Jayawijaya