Daftar episode Prison Break

Berikut adalah daftar episode Prison Break dari tahun 2005 sampai 2009. Templat:Spoiler

Tahun pertama (2005-2006)

#	Tanggal	Judul	Cerita
1.01	29/08/05	The Pilot	Michael Scofiled, seorang insinyur dari Chicago ditangkap tanpa perlawanan karena merampok bank. Ia dipenjara di Fox River. Di sana dia bertemu dengan kakaknya, Lincoln Burrows yang tengah menanti hukuman mati karena dituduh membunuh Terrence Stedman, adik wakil presiden. Michael mengatakan pada Lincoln bahwa ia akan membebaskan mereka berdua.
1.02	29/08/05	Allen	Kesulitan menghadang ketika terjadi kerusuhan di dalam penjara. Veronica menerima rekaman video yang menunjukkan Lincoln menembak Terrence Steadman.
1.03	05/09/05	Cell Test	Michael memperoleh dukungan Abruzzi dan membuktikan bahwa Sucre dapat dipercaya, tetapi kemudian Michael kehilangan satu bagian penting dari rencananya.
1.04	12/09/05	Cute Poison	Michael mendapat lebih banyak lagi peralatan dan orang-orang yang dia butuhkan, tetapi ada seseorang yang memperhatikan dan mulai bertanya-tanya apa tujuannya.
1.05	19/09/05	English, Fitz or Percy	Michael mendapat informasi penting terkait dengan pelariannya, tetapi dapatkah ia mempertahankan kepercayaan Kepala Penjara?
1.06	26/09/05	Riots, Drills and the Devil: Part 1	Ide Michael guna mendapat lebih banyak waktu untuk membuat lubang di selnya yaitu dengan memprovokasi terjadinya pengurungan narapidana, ternyata mendatangkan akibat yang sangat buruk.
1.07	03/10/05	Riots, Drills and the Devil: Part 2	Michael menyelamatkan Dr. Tancredi dari kerusuhan, tetapi Lincoln dan Veronica juga menemui kesulitan.
1.08	24/10/05	The Old Head	Veronica dan LJ harus bersembunyi. Michael secara tidak sengaja mengungkapkan motivasi Westmoreland untuk membantu pelarian..
1.09	31/10/05	Tweener	Dengan adanya Abruzzi bersusah payah mengembalikan kekuasan di penjara, nomor Fibonacci mulai disebut-sebut.
1.10	07/11/05	Sleight of Hand	Michael menyerahkan alamat pada Falzone, supaya pekerjaan dalam lorong dapat dilanjutkan. Sementara itu, para VP membutuhkan bantuan dari seseorang yang berbahaya.
1.11	14/11/05	And Then There Were 7	Michael dikunjungi isterinya, sementara Veronica dan Nick mendapat kunjungan dari Quinn.
1.12	21/11/05	Odd Man Out	C-Note mendengar pembicaraan Michael dan Lincoln yang mendiskusikan bahwa terlalu banyak orang yang terlibat dalam pelarian, dan mereka terpaksa harus meninggalkan satu orang. T-Bag merasa kedudukannya terancam dan menelepon sepupunya James Bagwell, menceritakan soal rencana pelarian dan meminta James menelepon Pope jika T-Bag tidak menghubunginya. Abruzzi menyuruh anak buahnya di luar penjara untuk menculik James, tetapi keadaan memburuk dan para gangster itu justru membunuh James dan putranya yang berusia lima tahun, Jimmy. Abruzzi merasa bersalah atas kematian anak tersebut dan memohon ampunan Tuhan. Sementara itu Veronica dan LJ membawa Nick ke rumah sakit dan selama Nick dioperasi, LJ pergi untuk menghadiri pemakaman ibunya. Daniel Hale melihat LJ di pemakaman tetapi tidak menangkapnya; kemudian dia menelepon Veronica dan membuat janji untuk bertemu di Highland Cafe. Maricruz mengatakan pada Sucre bahwa dia hamil, namun akan menikah dengan Hector. Kapten Bellick menekan David agar mendekati Michael dan mencari tahu semua rencananya. Michael memberi tahu kelompoknya bahwa mereka siap untuk lari malam itu, tetapi Lincoln masuk sel isolasi karena melindungi adiknya..
1.13	28/11/05	End of the Tunnel	Pelarian nyaris berjalan mulus sampai mereka membentur semacam penghalang dari besi. Di tempat lain, Veronica nyaris berhasil mendapatkan informasi untuk membuktikan bahwa Lincoln tidak bersalah.
1.14	20/03/06	The Rat	Pipa di penjara diganti dan waktu eksekusi semakin dekat, Michael harus memikirkan ulang rencana pelariannya sekaligus membebaskan kakaknya. Seorang rekan di Fox River mungkin menjadi kunci untuk menunda hukuman mati Lincoln.
1.15	27/03/06	By the Skin and the Teeth	Rencana pelarian Michael gagal. Ketika Lincoln diikat di kursi listrik, ia melihat wajah yang tidak asing. Apakah ia akan menjadi juru selamat, atau hidupnya harus berakhir?
1.16	03/04/06	Brother's Keeper	Kilas balik, menceritakan bagaimana tim Michael masuk ke Fox River. Bagaimana Company menjebak Lincoln dan cerita tentang bagaimana rencana Michael untuk menyelamatkan kakaknya.
1.17	10/04/06	J-Cat	Akibat punggungnya terbakar, tato Michael yang menunjukkan jalan keluar melalui ruang periksa pun menghilang. Ada narapidana lain yang mengendus rencana pelarian, Michael Scofield mau tidak mau harus mencari cara lain untuk keluar dari Fox River.
1.18	17/04/06	Bluff	Dengan rencana baru, Michael mencari rekan baru sebagai kunci berhasilnya pelarian. Tim Michael mendengar bahwa para penjaga melelang sel Michael. Lincoln dan Sucre membuat skenario supaya Michael kembali ke selnya. Veronica memberi tahu Lincoln bahwa L.J akan didakwa sebagai pembunuh ibunya, dan Lincoln ingin bertemu dengan LJ.
1.19	24/04/06	The Key	Setelah tabrakan, Kellerman berusaha membunuh Lincoln, tetapi seseorang menghalanginya. Sucre meninggalkan sel isolasi dan Michael mengatakan padanya bahwa petanya sudah lengkap, tapi dia butuh kunci ke klinik. Abruzzi kembali ke Fox River, tampaknya berubah menjadi orang yang religius. Pope menyuruh Bellick menemukan Lincoln sebelum menghubungi pihak berwajib. Nick berusaha meyakinkan Veronica bahwa mereka sudah tidak ada waktu untuk memeriksa ponsel Quinn. Namun Veronica tetap memeriksanya dan menemukan banyak telepon berasal dari Montana. Michael mencium Sara dan memintanya untuk menunggu. Tweener mengkonfrontasi Avocado. Lincoln sadar dan mengetahui bahwa orang misterius itu adalah ayahnya, Aldo Burrows, yang tadinya bekerja untuk Company, dan sesungguhnya Lincoln adalah korban dari sebuah skenario besar untuk menjegalnya. Aldo membocorkan soal EcoField dan Company menggunakan Lincoln supaya Aldo muncul. Michael meminta tolong pada Nika. Caroline Reynolds mengatakan pada kakaknya bahwa Terrence hidup hanya karena campur tangannya, dan Terrence tidak mengerti mengapa mereka belum membunuh Caroline. Abruzzi menemui T-Bag dan memintanya untuk melupakan segalanya. Nika menemui Sara dan bercerita soal dirinya dan bagaimana Michael membantunya. Tetapi Nika sebenarnya mencuri kunci Sara. Seseorang melaporkan telah melihat Mustang di sebuah tempat pembuangan mobil di mana Aldo dan Lincoln bersembunyi, tapi Kellerman menyadap pembicaraan itu dan pergi ke tempat yang dimaksud. Namun demikian, polisi datang dan Bellick menangkap Lincoln, menyelamatkannya dari Kellerman. Sara mencari kuncinya dan menduga bahwa Nika yang mencuri kuncinya. Sara segera meminta kunci ruangan itu diganti. Nick ternyata bekerja untuk Abruzzi. David mengkhianati Michael dan menceritakan rencana pelarian pada Bellick. Lincoln kembali ke Fox River dan dalam pengawasan ketat 24 jam..
1.20	01/05/06	Tonight	Westmoreland menggunakan Bellick untuk menutup lubang dalam rencana pelarian, yang memaksa Michael memajukan jadwal. Tweener yang ketakutan menyatakan kesetiaanya pada Michael dan sebagai imbalannya dia bisa keluar penjara; Michael merasa bahwa ia tidak punya pilihan dan harus melibatkan Sara dalam rencana. Nyawa Veronica terancam ketika sekutunya ternyata memiliki hubungan dengan salah satu narapidana di Fox River.
1.21	08/05/06	Go	Dr. Sarah diinterogasi apakah ia sengaja tidak mengunci ruangannya untuk membantu Michael, yang harus mengkhianati Pope untuk melaksanakan rencana pelariannya. Veronica menemukan bukti yang membawanya ke Montana, tapi ia sadar bahwa sekutunya telah berubah menjadi musuh. Michael, Lincoln dan yang lain berhasil keluar, tapi setelah alarm menyala, siapa yang berhasil melewati dinding, siapa yang tertinggal, dan siapa yang meninggalkan penjara dalam kantong mayat?
1.22	15/05/06	Flight	Setelah pelarian terjadi, hidup seakan berakhir bagi Pope dan Bellick dan mereka bertekad akan melakukan apapun untuk menangkap para buronan..