Tanaman kapas
| Tanaman kapas | |
|---|---|
| |
| Tanaman kapas spesies Gossypium arboreum | |
| Klasifikasi ilmiah | |
| Kerajaan: | |
| Subkerajaan: | |
| Divisi: | |
| Kelas: | |
| Subkelas: | |
| Ordo: | |
| Famili: | |
| Subfamili: | |
| Tribus: | |
| Genus: | Gossypium |
| Spesies | |
|
Lihat teks | |
| Sinonim[1] | |
| |
Gossypium (/ɡɒˈsɪpiəm/)[2] atau Tanaman kapas adalah genus tanaman berbunga dalam tribus Gossypieae, famili Malvaceae. Genus ini berasal dari daerah tropis dan subtropis di Dunia Lama dan Baru. Ada sekitar 50 spesies Gossypium[3] yang menjadikannya genus terbesar dalam tribus Gossypieae, dan spesies barunya banyak yang ditemukan.[3] Nama genusnya berasal dari kata Arab goz yang mengacu pada zat lunak.[4]
Genom Tanaman Kapas
Upaya pengurutan genom kapas secara publik dimulai10 pada tahun 2007 oleh konsorsium peneliti publik. Mereka menyepakati strategi untuk mengurutkan genom kapas allotetraploid yang dibudidayakan. "Allotetraploid" berarti genom spesies kapas ini terdiri dari dua subgenom berbeda, yang disebut sebagai At dan Dt (huruf 't' untuk tetraploid, untuk membedakannya dari genom A dan D spesies diploid terkait). Strateginya adalah dengan mengurutkan terlebih dahulu kerabat genom D dari kapas allotetraploid, G. raimondii, spesies kapas liar Amerika Selatan (Peru, Ekuador), karena ukurannya yang lebih kecil karena DNA yang kurang berulang (terutama retrotransposon). Ia mempunyai hampir sepertiga jumlah basa kapas tetraploid (AD), dan setiap kromosom hanya terdapat satu kali.[klarifikasi diperlukan] Genom A dari G. arboreum, spesies kapas 'Dunia Lama' (ditanam di India pada tahun tertentu), akan diurutkan berikutnya. Genomnya kira-kira dua kali ukuran genom G. raimondii. Setelah rangkaian genom A dan D terkumpul, maka penelitian dapat mulai mengurutkan genom sebenarnya dari varietas kapas budidaya tetraploid. Strategi ini tidak diperlukan; jika seseorang mengurutkan genom tetraploid tanpa model genom diploid, rangkaian DNA eukromatik dari genom AD akan berkumpul bersama dan elemen berulang dari genom AD akan berkumpul secara independen menjadi rangkaian A dan D. Maka tidak akan ada cara untuk mengurai kekacauan rangkaian AD tanpa membandingkannya dengan rangkaian diploidnya.
Upaya sektor publik berlanjut dengan tujuan untuk membuat rancangan urutan genom berkualitas tinggi dari pembacaan yang dihasilkan oleh semua sumber. Upaya sektor publik telah menghasilkan pembacaan BAC, fosmid, dan plasmid Sanger, serta 454 pembacaan. Jenis pembacaan selanjutnya ini akan berperan penting dalam menyusun draf awal genom D. Pada tahun 2010, dua perusahaan (Monsanto dan Illumina), menyelesaikan pengurutan Illumina yang cukup untuk mencakup genom D G. raimondii sekitar 50x. Mereka mengumumkan akan menyumbangkan bacaan mentah mereka kepada publik. Upaya hubungan masyarakat ini memberi mereka pengakuan atas pengurutan genom kapas. Setelah genom D dirakit dari semua bahan mentah ini, tidak diragukan lagi hal ini akan membantu dalam perakitan genom AD pada varietas kapas yang dibudidayakan, namun masih banyak kerja keras yang harus dilakukan.
Hama dan Penyakit
Daftar spesies
- Subgenus Gossypium
- Gossypium anomalum Wawra & Peyr.
- Gossypium arboreum L.
- Gossypium herbaceum L.
- Subgenus Houzingenia
- Gossypium raimondii Ulbr.
- Gossypium thurberi Tod.
- Subgenus Karpas
- Gossypium barbadense L.
- Gossypium darwinii G.Watt
- Gossypium hirsutum L.
- Gossypium mustelinum Miers ex G.Watt
- Gossypium tomentosum Nutt. ex Seem
- Subgenus Sturtia
Referensi
- ^ a b "Genus: Gossypium L". Germplasm Resources Information Network. United States Department of Agriculture. 2007-03-12. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2011-07-17. Diakses tanggal 2011-09-08.
- ^ "Gossypium". Merriam-Webster Dictionary. Diakses tanggal 2020-05-19.
- ^ a b Wendel JF, Brubaker C, Alvarez I, et al. (2009). "Evolution and Natural History of the Cotton Genus". Dalam Andrew H. Paterson. Plant Genetics and Genomics: Crops and Models. 3. hlm. 3–22. doi:10.1007/978-0-387-70810-2_1. ISBN 978-0-387-70809-6.
- ^ Gledhill, D. (2008). The Names of Plants (edisi ke-4). Cambridge University Press. hlm. 182. ISBN 978-0-521-86645-3.
- ^ "Gossypium". Integrated Taxonomic Information System.
- ^ "GRIN Species Records of Gossypium". Germplasm Resources Information Network. United States Department of Agriculture. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2015-09-24. Diakses tanggal 2011-09-08.