Excavata
Excavata adalah kumpulan utama dari eukariota[1] bersel satu.[2] Kategori filogenetik Excavata terdiri atas bermacam-macam bentuk yang hidup bebas atau bersimbiosis dan termasuk beberapa parasit manusia yang penting.
| Excavata Rentang waktu:
| |
|---|---|
| |
| Giardia lamblia, diplomonad parasit | |
Klasifikasi ilmiah  (kelompok lawas yang bersifat parafiletik) | |
| Domain: | Eukaryota |
| (tanpa takson): | Excavata (Cavalier-Smith) Simpson, 2003 |
| Filum | |
Ciri-ciri
suntingBanyak excavata telah kehilangan mitokondria 'klasik' - organisme ini sering disebut 'amitokondriata' (yang berarti 'tidak bermitokondria'), meski kebanyakan, mungkin semua, tetap memiliki organel mitokondia dalam bentuk yang sangat termodifikasi. Yang lainnya memiliki mitokondria dengan krista tubuler, diskoid atau lembaran dalam kasus tertentu. Banyak excavates memiliki dua, empat atau lebih flagel[3] dan banyak yang mempunyai lekukan makanan ventral yang mencolok dengan ultrastruktur khas ditunjang oleh mikrotubulus.[4] Akan tetapi, bermacam kelompok yang tidak punya ciri ini dianggap sebagai excavata berdasarkan bukti genetis (terutama pohon filogenetik dari sekuensi molekuler).
Pengelompokan
suntingExcavata diklasifikasikan menjadi empat kelompok utama pada tingkat filum atau superfilum. Ini ditunjukkan oleh tabel di bawah ini.
| Superfilum | Filum | Genera Representatif | Deskripsi |
|---|---|---|---|
| Discoba | Euglenozoa | contoh Euglena, Trypanosoma | Banyak parasit penting, satu kelompok yang berplastida (kloroplas). |
| Percolozoa (Heterolobosea) | contoh Naegleria, Acrasis | Banyak yang berganti-ganti bentuk antara bentuk berflagel dan amoeboid (mirip amoeba). | |
| Loukozoa (Jakobida) | contoh Jakoba, Reclinomonas | Hidup bebas, kadang-kadang berflagel lorikat. Beberapa anggotanya amitokondriata. | |
| Metamonada | Preaxostyla | contoh Oxymonads, Trimastix | Flagelata amitokontriata, ada yang hidup bebas (Trimastix) atau hidup di usus belakang serangga |
| Fornicata | contoh Giardia, Carpediemonas | Amitokondriata, kebanyakan bersimbiosis dan parasit binatang. | |
| Parabasalia | contoh Trichomonas | Flagelata amitokontriata, biasanya komensal di usus serangga. Beberapa penyebab penyakit manusia. |
Heterolobosea (Percolozoa) dan Euglenozoa tampaknya berhubungan dan disatukan oleh keberadaan krista diskoid dalam mitokondrianya (Superfilum Discicristata). Baru-baru ini hubungan erat telah ditunjukkan antara Discicristata dan Jakobida.[5] Kebanyakan jakobida berkrista tubuler, seperti kebanyakan protista lain, sedangkan metamonada tidak biasa karena kehilangan mitokondria klasiknya; sebagai gantinya, mereka memiliki 'hidrogenosom', 'mitosom' atau organel tak berciri. Selain grup pada tabel di atas, genus Malawimonas umumnya dianggap sebagai anggota Excavata karena morfologi excavatanya yang khas dan keterkaitan filogenetis dengan grup-grup excavata pada beebrapa filogeni molekuler. namun, kedudukannya di antara excavata belum dipahami.
kekerabatan excavata belum pasti; mungkin mereka bukan kelompok yang monofiletik. kemonofiletikan excavata jauh dari kejelasan, meskipun kelihatannya ada beberapa klad dalam excavata yang monofiletik.[6]
Excavata tertentu sering dianggap eukariota primitif, sebagian berdasarkan penempatan mereka pada banyak pohon evolusioner. hal ini dapat mendorong usulan bahwa excavata adalah tingkat parafiletik yang termasuk moyang dari eukariota yang hidup sekarang. Namun penempatan excavata tertentu sebagai 'cabang awal' mungkin merupakan artifak analisis yang diakibatkan oleh tarikan cabang panjang, seperti yang telah dilihat pada beberapa grup lain, contohnya, microsporidia.
Rujukan
sunting- ^ Hampl V, Hug L, Leigh JW; et al. (2009). "Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups"". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (10): 3859–64. doi:10.1073/pnas.0807880106. PMID 19237557.
- ^ Simpson, Ag; Inagaki, Y; Roger, Aj (2006), "Comprehensive multigene phylogenies of excavate protists reveal the evolutionary positions of "primitive" eukaryotes" (Free full text), Molecular biology and evolution, 23 (3): 615–25, doi:10.1093/molbev/msj068, PMID 16308337
- ^ Simpson AG (2003). "Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota)". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 53 (Pt 6): 1759–77. doi:10.1099/ijs.0.02578-0. PMID 14657103. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2012-12-09. Diakses tanggal 2009-04-07.
- ^ Cavalier-Smith T (2002). "The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 2): 297–354. PMID 11931142. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2017-07-29. Diakses tanggal 2009-04-07.
- ^ Naiara Rodríguez-Ezpeleta, Henner Brinkmann, Gertraud Burger, Andrew J. Roger, Michael W. Gray, Hervé Philippe, and B. Franz Lang (August 2007). "Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans". Curr. Biol. 17 (16): 1420–1425. doi:10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID 17689961.
- ^ Laura Wegener Parfrey, Erika Barbero, Elyse Lasser, Micah Dunthorn, Debashish Bhattacharya, David J Patterson, and Laura A Katz (December 2006). "Evaluating Support for the Current Classification of Eukaryotic Diversity". PLoS Genet. 2 (12): e220. doi:10.1371/journal.pgen.0020220. PMID 17194223.