GenBank
Basis data sekuens GenBank merupakan akses terbuka, koleksi beranotasi dari semua sekuens nukleotida yang tersedia untuk umum dan terjemahan protein mereka. Basis data ini diproduksi dan dikelola oleh National Center for Biotechnology Information (NCBI) bagian dari Institut Kesehatan Nasional di Amerika Serikat, yang juga menjadi bagian dari International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).
| Konten | |
|---|---|
| Deskripsi | Pengurutan nukleotida untuk lebih dari 300.000 organisme dengan anotasi bibliografi dan biologis yang mendukung. |
| Jenis data |
|
| Organisme | Semua |
| Kontak | |
| Pusat penelitian | NCBI |
| Kutipan utama | 21071399 |
| Tanggal rilis | 1982 |
| Akses | |
| Format data | |
| Situs web | NCBI |
| URL pengunduhan | ncbi ftp |
| URL layanan web | |
| Perangkat | |
| Web | BLAST |
| Perangkat lunak | BLAST |
| Lain-lain | |
| Lisensi | Tidak jelas[1] |
GenBank dan kolaboratornya menerima sekuens urutan lebih dari 100.000 organisme berbeda yang diproduksi di laboratorium di seluruh penjuru dunia. Basis data dimulai pada tahun 1982 oleh Walter Goad dan Laboratorium Nasional Los Alamos. GenBank telah menjadi basis data penting untuk penelitian di bidang biologi dan telah tumbuh pesat dalam beberapa tahun terakhir, mencapai tingkat pertumbuhan eksponensial dengan berhasil menggandakan jumlah data dalam waktu 18 bulan.[2][3]
Rilis 194, diproduksi pada Februari 2013, berisi lebih dari 150 miliar data nukleotida di lebih dari 162 juta sekuens.[4] GenBank dibangun dengan pengiriman data langsung dari laboratorium individu, dan juga pengiriman data massal dari pusat sekuensing skala besar.
Referensi
sunting- ^ The download page Diarsipkan 2020-01-27 di Wayback Machine. at UCSC says "NCBI places no restrictions on the use or distribution of the GenBank data. However, some submitters may claim patent, copyright, or other intellectual property rights in all or a portion of the data they have submitted. NCBI is not in a position to assess the validity of such claims, and therefore cannot provide comment or unrestricted permission concerning the use, copying, or distribution of the information contained in GenBank."
- ^ Benson D; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Wheeler, D. L.; et al. (2008). "GenBank". Nucleic Acids Research. 36 (Database): D25–D30. doi:10.1093/nar/gkm929. PMC 2238942
. PMID 18073190.
- ^ Benson D; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Sayers, E. W.; et al. (2009). "GenBank". Nucleic Acids Research. 37 (Database): D26–D31. doi:10.1093/nar/gkn723. PMC 2686462 . PMID 18940867.
- ^ "GenBank release notes". NCBI. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2016-12-22. Diakses tanggal 2020-01-27.
