ONIOM

ONIOM merupakan kependekan dari "our own n-layered integrated molecular orbital and molecular mechanics" yakni suatu pendekatan komputasi yang dikembangkan oleh Morokuma dan rekan-rekan kerjanya. ONIOM sebetulnya metode hibrid yang menyertakan beragam level teori dalam perhitungannya namun diterapkan pada atom-atom atau subunit yang berbeda dalam molekul. Sama halnya ketika mengupas bawang, maka dapat diperoleh berbagai lapisan yang satu sama lain saling berkaitan.^[1]^[2]^[3] Dalam mengkaji molekul besar menggunakan komputasi kuantum, tentu ONIOM merupakan metode yang mutakhir, bahkan biomolekul juga sudah banyak dihitung menggunakan metode ONIOM.^[4] serta untuk kompleks logam transisi dan katalisis.^[5] Secara Umum, ONIOM dapat digolongkan menjadi ONIOM dua lapis dan ONIOM tiga lapis. Adapun penggolongan tersebut berdasarkan kebutuhan untuk mencapai akurasi yang baik dan "computational cost" yang rendah.

Perangkat Lunak sunting

Berbagai perangkat lunak yang mendukung untuk menggunakan ONIOM yang diketahui hingga saat ini:

Rujukan sunting

^ Dapprich, I. Komaromi, K.S. Byun, K. Morokuma, and M.J. Frisch (1999). "A new ONIOM implementation in Gaussian98. Part I. The calculation of energies, gradients, vibrational frequencies and electric field derivatives". Journal of Molecular Structure: THEOCHEM. 461-462: 1. doi:10.1016/S0166-1280(98)00475-8.
^ Vreven, T; Morokuma, K (2006). "Chapter 3 Hybrid Methods: ONIOM(QM:MM) and QM/MM". Annual Reports in Computational Chemistry. 2: 35. doi:10.1016/S1574-1400(06)02003-2.
^ Svensson, Mats; Humbel, StéPhane; Froese, Robert D. J.; Matsubara, Toshiaki; Sieber, Stefan; Morokuma, Keiji (1996). "ONIOM: A Multilayered Integrated MO + MM Method for Geometry Optimizations and Single Point Energy Predictions. A Test for Diels−Alder Reactions and Pt(P(t-Bu)3)2+ H2Oxidative Addition". The Journal of Physical Chemistry. 100 (50): 19357. doi:10.1021/jp962071j.
^ Senn, H; Thiel, W (2007). "QM/MM studies of enzymes". Current Opinion in Chemical Biology. 11 (2): 182–7. doi:10.1016/j.cbpa.2007.01.684. PMID 17307018.
^ Ananikov, Valentine P.; Musaev, Djamaladdin G.; Morokuma, Keiji (2010). "Real size of ligands, reactants and catalysts: Studies of structure, reactivity and selectivity by ONIOM and other hybrid computational approaches☆". Journal of Molecular Catalysis A: Chemical. 324: 104. doi:10.1016/j.molcata.2010.03.015.

Artikel bertopik kimia ini adalah sebuah rintisan. Anda dapat membantu Wikipedia dengan mengembangkannya.

[1] Dapprich, I. Komaromi, K.S. Byun, K. Morokuma, and M.J. Frisch (1999). "A new ONIOM implementation in Gaussian98. Part I. The calculation of energies, gradients, vibrational frequencies and electric field derivatives". Journal of Molecular Structure: THEOCHEM. 461-462: 1. doi:10.1016/S0166-1280(98)00475-8.

[2] Vreven, T; Morokuma, K (2006). "Chapter 3 Hybrid Methods: ONIOM(QM:MM) and QM/MM". Annual Reports in Computational Chemistry. 2: 35. doi:10.1016/S1574-1400(06)02003-2.

[3] Svensson, Mats; Humbel, StéPhane; Froese, Robert D. J.; Matsubara, Toshiaki; Sieber, Stefan; Morokuma, Keiji (1996). "ONIOM: A Multilayered Integrated MO + MM Method for Geometry Optimizations and Single Point Energy Predictions. A Test for Diels−Alder Reactions and Pt(P(t-Bu)3)2+ H2Oxidative Addition". The Journal of Physical Chemistry. 100 (50): 19357. doi:10.1021/jp962071j.

[4] Senn, H; Thiel, W (2007). "QM/MM studies of enzymes". Current Opinion in Chemical Biology. 11 (2): 182–7. doi:10.1016/j.cbpa.2007.01.684. PMID 17307018.

[5] Ananikov, Valentine P.; Musaev, Djamaladdin G.; Morokuma, Keiji (2010). "Real size of ligands, reactants and catalysts: Studies of structure, reactivity and selectivity by ONIOM and other hybrid computational approaches☆". Journal of Molecular Catalysis A: Chemical. 324: 104. doi:10.1016/j.molcata.2010.03.015.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]