Schizosaccharomyces pombe
| Schizosaccharomyces pombe | |
|---|---|
| |
| Klasifikasi ilmiah | |
| Kerajaan: | |
| Divisi: | |
| Kelas: | |
| Ordo: | |
| Famili: | |
| Genus: | |
| Spesies: | S. pombe
|
| Nama binomial | |
| Schizosaccharomyces pombe Lindner (1893)
| |
Schizosaccharomyces pombe, juga disebut "khamir fisi", adalah spesies khamir yang digunakan dalam pembuatan bir tradisional dan sebagai organisme model dalam biologi molekuler dan biologi sel. S. pombe adalah eukariota uniseluler, yang selnya berbentuk batang. Sel biasanya berdiameter 3 sampai 4 mikrometer dan panjang 7 sampai 14 mikrometer. Genomnya, yang kira-kira 14,1 juta pasangan basa, diperkirakan mengandung 4.970 gen pengkode protein dan setidaknya 450 RNA bukan pengode.[1]
Sel-sel S. pombe mempertahankan bentuknya dengan tumbuh secara eksklusif melalui ujung sel dan membelah dengan fisi medial untuk menghasilkan dua sel anak dengan ukuran yang sama, yang membuat S. pombe menjadi alat yang hebat dalam penelitian siklus sel.
Khamir fisi diisolasi pada tahun 1893 oleh Paul Lindner dari bir millet Afrika Timur. Nama spesies pombe adalah bahasa Swahili untuk bir. S. pombe pertama kali dikembangkan sebagai model eksperimental pada tahun 1950an: oleh Urs Leupold untuk mempelajari genetika,[2][3] dan oleh Murdoch Mitchison untuk mempelajari siklus sel.[4][5][6]
Paul Nurse, seorang peneliti khamir fisi, berhasil menggabungkan sekolah independen genetika khamir fisi dan penelitian siklus sel. Bersama dengan Lee Hartwell dan Tim Hunt, Nurse memenangkan Penghargaan Nobel Fisiologi atau Kedokteran tahun 2001 untuk karya mereka mengenai regulasi siklus sel.
Urutan genom S. pombe diterbitkan pada tahun 2002, oleh sebuah konsorsium yang dipimpin oleh Sanger Institute, menjadi organisme model eukariotik keenam yang genomnya telah sepenuhnya diurutkan. Ini telah sepenuhnya membuka kekuatan organisme ini, dengan banyak gen yang homolog dengan gen penyakit manusia diidentifikasi. Pada tahun 2006, lokalisasi sub-seluler hampir semua protein di S. pombe diterbitkan dengan menggunakan protein fluoresen hijau sebagai label molekuler.[7]
Schizosaccharomyces pombe juga telah menjadi organisme penting dalam mempelajari respons seluler terhadap kerusakan DNA dan proses replikasi DNA.
Sekitar 160 strain alami S. pombe telah diisolasi. Strain-strain ini telah dikumpulkan dari berbagai lokasi termasuk Eropa, Amerika Utara dan Selatan, dan Asia. Mayoritas strain ini dikumpulkan dari buah-buahan yang dibudidayakan seperti apel dan anggur, atau dari berbagai minuman beralkohol, seperti Cachaça Brasil. S. pombe juga ada dalam teh fermentasi, kombucha.[8] Tidak jelas sekarang apakah S. pombe adalah pemfermentasi utama atau kontaminan di minuman tersebut. Ekologi alami khamir Schizosaccharomyces tidak diketahui dengan baik.
Referensi
sunting- ^ Wilhelm; et al. (2008). "Dynamic repertoire of a eukaryotic transcriptome surveyed at single-nucleotide resolution". Nature. 453 (7199): 1239–1243. doi:10.1038/nature07002. PMID 18488015.
- ^ Leupold, U (1950). "Die Vererbung von Homothallie und Heterothallie bei Schizosaccharomyces pombe". CR Trav Lab Carlsberg Ser Physiol. 24: 381–480.
- ^ Leupold U. (1993) The origins of Schizosaccharomyces pombe genetics. In: Hall MN, Linder P. eds. The Early Days of Yeast Genetics . New York. Cold Spring Harbor Laboratory Press. p 125–128.
- ^ Mitchison, JM (1957). "The growth of single cells. I. Schizosaccharomyces pombe". Exp Cell Res. 13: 244–262. doi:10.1016/0014-4827(57)90005-8.
- ^ Mitchison, JM (1990). "My favourite cell: The fission yeast, Schizosaccharomyces pombe". BioEssays. 4: 189–191. doi:10.1002/bies.950120409.
- ^ Fantes PA; Hoffman CS (2016). "A Brief History of Schizosaccharomyces pombe Research: A Perspective Over the Past 70 Years". Genetics. 203 (2): 621–9. doi:10.1534/genetics.116.189407. PMID 27270696.
- ^ Matsuyama; et al. (2006). "ORFeome cloning and global analysis of protein localization in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe". Nature Biotechnology. 24 (7): 841–847. doi:10.1038/nbt1222. PMID 16823372.
- ^ Teoh, Ai Leng (September 2004). "Yeast ecology of Kombucha fermentation". International Journal of Food Microbiology. 95 (2): 119–26. doi:10.1016/j.ijfoodmicro.2003.12.020. PMID 15282124.
Pranala luar
sunting
