Dalam konteks investigasi dan penuntutan kasus terkait dua atau lebih NegaraAnggotanegara anggota, tujuan Eurojust adalah untuk merangsang dan meningkatkan koordinasi antara otoritas nasional masing-masing, dengan mempertimbangkan setiap permintaan yang datang dari otoritas yang berkompeten dari Negaranegara Anggotaanggota dan informasi apa pun yang diberikan oleh badan yang kompeten olehharus sesuai dengan kebajikan ketentuan yang telah diadopsi dalamdari kerangka Perjanjian (Jaringan Yudisial Eropa dalam masalah kriminal, [[Europol]], dan OLAF).<ref name="What"/>
Tujuan lain dari Eurojust adalah untuk meningkatkan kerja sama antara pihak yang berwenang, khususnya dengandalam memfasilitasi pelaksanaan bantuan hukum timbal balik tingkat internasional dan pelaksanaan Waran Penahanan Eropa. Eurojust juga mendukung pihak yang berwenang untuk meningkatkan efektivitas penyelidikan dan penuntutantuntutan terhadapa kasus yang dihadapi.<ref name="What"/> Hal ini tentu dapat membantu penyelidikan dan penuntutan antara Negaranegara Anggotaanggota dan Negaranegara non-Anggotaanggota atau Negaranegara Anggotaanggota dan Komisikomisi, khususnya tentang pelanggaran pidana yang mempengaruhiefek dari kejahatan itu dapat memengaruhi kepentingan keuangan Uni Eropa. Kejahatan serius lainnya yang juga sering terjadi seperti perdagangan ilegal obat terlarang ilegal, pencucian uang, kejahatan yang terkait dengan [[zat nuklir] dan [|radioaktif]], penyelundupan imigran gelap atau perdagangan manusia, pembunuhan, cedera tubuh yang berat, perdagangan organ dan jaringan tubuh manusia, penculikan ataupun penyanderaan, [[rasisme]] dan [[xenofobia]].
