Promoter inti
Promoter inti (bahasa Inggris: core promoter, RNA polymerase II core promoter) adalah area pada gen sel eukariota yang disebut pulau CpG, yang terdiri dari kotak TATA, INR, kotak GC, kotak CCAAT,[1] BRE, MTE, DCE dan DPE.[2] Promoter inti merupakan tempat awal terjadinya proses transkripsi oleh RNA polimerase II dan tempat proses transkripsi tersebut dikendalikan.[3] Hingga saat ini, hanya kotak TATA dan INR yang dapat mengarahkan proses inisiasi transkripsi oleh RNA polimerase II dengan akurat.[4]
Promoter ini dapat menginisiasi dua jenis transkripsi:[5]
- Inisiasi terfokus, jika transkripsi dimulai dari sebuah nukleotida atau di dalam sebuah kluster dari beberapa nukleotida. Promoter inti dengan inisiasi terfokus ditandai dengan adanya kotak TATA dan DPE.
- Inisiasi terdispersi, jika transkripsi dimulai serentak pada banyak promoter inti yang melibatkan lebih dari 50 nukleotida. Model inisiasi ini ditemukan pada hampir 2/3 makhluk vertebrata. Gen yang terkendali cenderung untuk memiliki promoter inti terfokus, sedangkan gen konstitutif sering kali memiliki promoter inti yang terdispersi. Oleh sebab itu, pada vertebrata, promoter inti terfokus ditemukan pada fraksi gen yang pendek namun memiliki fungsi biologis yang sangat vital.
Rujukan
- ^ (Inggris) "Identification and characterization of the potential promoter regions of 1031 kinds of human genes". Department of Virology, Institute of Medical Science, University of Tokyo; Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J, Taira H, Mizushima-Sugano J, Hata H, Ota T, Isogai T, Tanaka T, Nakamura Y, Suyama A, Sakaki Y, Morishita S, Okubo K, Sugano S. Diakses tanggal 2010-08-19.
- ^ (Inggris) "Perspectives on the RNA polymerase II core promoter". Section of Molecular Biology, University of California; Juven-Gershon T, Hsu JY, Kadonaga JT. Diakses tanggal 2010-08-19.
- ^ (Inggris) "Mammalian RNA polymerase II core promoters: insights from genome-wide studies". Genome Exploration Research Group (Genome Network Project Core Group), RIKEN Genomic Sciences Center (GSC), RIKEN Yokohama Institute; Sandelin A, Carninci P, Lenhard B, Ponjavic J, Hayashizaki Y, Hume DA. Diakses tanggal 2010-08-19.
- ^ (Inggris) "Core promoter-selective RNA polymerase II transcription". Transcription Laboratory, Marie Curie Research Institute; Gross P, Oelgeschläger T. Diakses tanggal 2010-08-19.
- ^ (Inggris) "Regulation of gene expression via the core promoter and the basal transcriptional machinery". Section of Molecular Biology, 0347, University of California; Juven-Gershon T, Kadonaga JT. Diakses tanggal 2010-08-19.