Ada yang mengatakan, pada suatu malam di dapur, Kakaknya, Burke Ramsey marah karena JonBenét telah mengambil satu buah nanas dari mangkuknya, tak tahan dengan emosinya, Burke kemudian mengambil sebuah senter (ukuran sedang) lalu memukul keras ke kepala JonBenét hingga tak sengaja meninggal. Teori tersebut sangat meyakini karena terdapat semangkuk nanas susu kemungkinan milik Burke karena terdapat sidik jari Burke di mangkuk dan sendok tersebut. Pada saat dilakukan otopsi jenazah JonBenét juga ditemukan nanas yang masih bersisabelum dicerna diperut JonBenét, kemungkinan nanas tersebut dimakan JonBenét hanya sekitar satu jam sebelum JonBenét tewas.
KarenaAda yang mengatakan juga, orangtua JonBenét takuttidak kehilanganrela Burke Ramseyditahan polisi karena anak sulungnya sudah menghilangkan nyawa adiknya, akhirnyakemudian John dan Patsy membuat skenario yaitu menulis surat yang menyatakan jika JonBenét diculik. Pada saat wawancara polisi (tertutup) kepada Burke, tampak gaya bicara dan dialog percakapan Burke berbeda dengan anak seumurannya. Banyak yang berspekulasi jika orang tua JonBenét sudah melatih dan memberikan dialog kepada Burke saat nantinya ditanya polisi. Bahkan dua lubang (luka) yang terdapat pada leher JonBenét sama persis dari salah satu mainan Burke.
