Amorphea

Amorphea; Rentang waktu: Ektasium Awal - Masa kini, 1400–0 Ma Fa. Proterozoikum Arkaikum Had.
Klasifikasi ilmiah
Domain:	Eukaryota
Klad:	Amorphea; Adl et al., 2012
Subkelompok
	Obazoa Breviatea; Apusomonadida; Opisthokonta Holomycota; Holozoa; ; ; Amoebozoa;
Sinonim
	Unikonta nom. nud.; Opimoda Derelle et al., 2015;

Amorphea^[1] (sebelumnya Unikonta) adalah sebuah supergrup taksonomis yang mencakup Amoebozoa basal dan Obazoa. Obazoa sendiri mencakup Opisthokonta yang mencakup Fungi, Animalia dan Choanoflagellata. Afinitas taksonomi dari anggota-anggota klad ini awalnya dideskripsikan dan diusulkan oleh Thomas Cavalier-Smith pada 2002.^[2]^[4]

Masyarakat Protistolog Internasional, badan taksonomi yang diakui untuk protozoa, menyarankan pada 2012, bahwa istilah Unikonta harus diganti menjadi Amorphea karena nama tersebut didasari oleh sinapomorfi yang dihipotesiskan, yang belakangan ditolak oleh penulis ISOP dan ilmuwan-ilmuwan lainnya.^[1]^[5]

Kelompok ini mencakup amoebozoa, opisthokont,^[6]^[7] dan Apusomonada.^[8]

Pencirian

Amorphea memiliki fusi gen rangkap tiga yang tidak dapat ditemukan pada bikonta. Ketiga gen yang menyatu pada amorphea, mengkode enzium untuk sintese nukleotida pirimidin:sintese fosfat karbamoil, dihidroorotase, karbamoiltransferase aspartat. Hal tersebut seharunya melibatkan fusi ganda, yang merupakan sebuah peristiwa langka, mendukung leluhur bersama Opisthokonta dan Amoebozoa.

Klad

Kelompok ini mencakup sel eukariota yang, sebagian besar, memiliki satu flagela yang muncul, atau adalah amoeba tanpa flagela. Unikonta meliputi opisthokonta (hewan, jamur, dan bentuk terkait) dan Amoebozoa. Sebaliknya, kelompok eukariota lain yang lebih dikenal, yang lebih sering memiliki dua flagela yang muncul (meskipun ada banyak pengecualian), sering disebut sebagai bikonta. Bikonta meliputi Archaeplastida (tumbuhan dan kerabatnya) dan supergugus SAR, Cryptista, Haptista, Telonemia, dan picozoa.

Eukaryotes

	Holomycota (inc. fungi)

	Holozoa (inc. animals)

1300 mya

1500 mya

Diphoda

	? Metamonada

	Discoba

Diaphoretickes

Cryptista

Archaeplastida

	Rhodophyta (red algae)

	Picozoa

	Glaucophyta
1100 mya
	Viridiplantae (plants)
1000 mya

1600 mya

SAR

550 mya

	Alveolata

	go777

Bikonts

2200 mya

Satu pandangan tentang kerajaan besar dan kelompok batang mereka.^[9]^[10]^[11]^[12] Metamonada sulit untuk ditempatkan, mungkin sebagai saudara dari Discoba, mungkin sebagai saudara dari Malawimonada.^[12]

Referensi

^ ^a ^b ^c Adl SM, Simpson AG, Lane CE, Lukeš J, Bass D, Bowser SS, Brown MW, Burki F, Dunthorn M, Hampl V, Heiss A, Hoppenrath M, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, McManus H, Mitchell EA, Mozley-Stanridge SE, Parfrey LW, Pawlowski J, Rueckert S, Shadwick RS, Schoch CL, Smirnov A, Spiegel FW (September 2012). "The revised classification of eukaryotes". J Eukaryot Microbiol. 59 (5): 429–93. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872  . PMID 23020233.
^ ^a ^b Cavalier-Smith T (March 2002). "The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 2): 297–354. doi:10.1099/00207713-52-2-297. PMID 11931142.
^ Derelle, Romain; Torruella, Guifré; Klimeš, Vladimír; Brinkmann, Henner; Kim, Eunsoo; Vlček, Čestmír; Lang, B. Franz; Eliáš, Marek (17 February 2015). "Bacterial proteins pinpoint a single eukaryotic root". Proceedings of the National Academy of Sciences (dalam bahasa Inggris). 112 (7): E693–E699. Bibcode:2015PNAS..112E.693D. doi:10.1073/pnas.1420657112  . PMC 4343179  . PMID 25646484.
^ Cavalier-Smith, Thomas (2003). "Protist phylogeny and the high-level classification of Protozoa". European Journal of Protistology. 39 (4): 338–348. doi:10.1078/0932-4739-00002.
^ Roger AJ, Simpson AG (2009). "Evolution: revisiting the root of the eukaryote tree". Current Biology. 19 (4): R165–R167. doi:10.1016/j.cub.2008.12.032  . PMID 19243692.
^ A Minge M, Silberman JD, Orr RJ, et al. (November 2008). "Evolutionary position of breviate amoebae and the primary eukaryote divergence". Proc. Biol. Sci. 276 (1657): 597–604. doi:10.1098/rspb.2008.1358. PMC 2660946  . PMID 19004754.
^ Burki F, Pawlowski J (October 2006). "Monophyly of Rhizaria and multigene phylogeny of unicellular bikonts". Mol. Biol. Evol. 23 (10): 1922–30. doi:10.1093/molbev/msl055. PMID 16829542.
^ Burki, Fabien; Roger, Andrew J.; Brown, Matthew W.; Simpson, Alastair G. B. (2020-01-01). "The New Tree of Eukaryotes". Trends in Ecology & Evolution. 35 (1): 43–55. doi:10.1016/j.tree.2019.08.008  . ISSN 0169-5347. PMID 31606140.
^ Brown, Matthew W.; Heiss, Aaron A.; Kamikawa, Ryoma; Inagaki, Yuji; Yabuki, Akinori; Tice, Alexander K; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-Ichiro; Hashimoto, Tetsuo; Simpson, Alastair; Roger, Andrew (2018-01-19). "Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super-Group". Genome Biology and Evolution. 10 (2): 427–433. doi:10.1093/gbe/evy014. PMC 5793813  . PMID 29360967.
^ Schön ME, Zlatogursky VV, Singh RP, et al. (2021). "Picozoa are archaeplastids without plastid". Nature Communications. 12 (1): 6651. bioRxiv 10.1101/2021.04.14.439778  Periksa nilai |biorxiv= (bantuan). doi:10.1038/s41467-021-26918-0. PMC 8599508  Periksa nilai |pmc= (bantuan). PMID 34789758 Periksa nilai |pmid= (bantuan).
^ Tikhonenkov DV, Mikhailov KV, Gawryluk RM, et al. (December 2022). "Microbial predators form a new supergroup of eukaryotes". Nature. 612 (7941): 714–719. doi:10.1038/s41586-022-05511-5. PMID 36477531 Periksa nilai |pmid= (bantuan).
^ ^a ^b Burki, Fabien; Roger, Andrew J.; Brown, Matthew W.; Simpson, Alastair G.B. (2020). "The New Tree of Eukaryotes". Trends in Ecology & Evolution. Elsevier BV. 35 (1): 43–55. doi:10.1016/j.tree.2019.08.008  . ISSN 0169-5347. PMID 31606140.

[Adl2012-1] Adl SM, Simpson AG, Lane CE, Lukeš J, Bass D, Bowser SS, Brown MW, Burki F, Dunthorn M, Hampl V, Heiss A, Hoppenrath M, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, McManus H, Mitchell EA, Mozley-Stanridge SE, Parfrey LW, Pawlowski J, Rueckert S, Shadwick RS, Schoch CL, Smirnov A, Spiegel FW (September 2012). "The revised classification of eukaryotes". J Eukaryot Microbiol. 59 (5): 429–93. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872  . PMID 23020233.

[pmid11931142-2] Cavalier-Smith T (March 2002). "The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 2): 297–354. doi:10.1099/00207713-52-2-297. PMID 11931142.

[3] Derelle, Romain; Torruella, Guifré; Klimeš, Vladimír; Brinkmann, Henner; Kim, Eunsoo; Vlček, Čestmír; Lang, B. Franz; Eliáš, Marek (17 February 2015). "Bacterial proteins pinpoint a single eukaryotic root". Proceedings of the National Academy of Sciences (dalam bahasa Inggris). 112 (7): E693–E699. Bibcode:2015PNAS..112E.693D. doi:10.1073/pnas.1420657112  . PMC 4343179  . PMID 25646484.

[4] Cavalier-Smith, Thomas (2003). "Protist phylogeny and the high-level classification of Protozoa". European Journal of Protistology. 39 (4): 338–348. doi:10.1078/0932-4739-00002.

[Roger2009-5] Roger AJ, Simpson AG (2009). "Evolution: revisiting the root of the eukaryote tree". Current Biology. 19 (4): R165–R167. doi:10.1016/j.cub.2008.12.032  . PMID 19243692.

[pmid19004754-6] A Minge M, Silberman JD, Orr RJ, et al. (November 2008). "Evolutionary position of breviate amoebae and the primary eukaryote divergence". Proc. Biol. Sci. 276 (1657): 597–604. doi:10.1098/rspb.2008.1358. PMC 2660946  . PMID 19004754.

[pmid16829542-7] Burki F, Pawlowski J (October 2006). "Monophyly of Rhizaria and multigene phylogeny of unicellular bikonts". Mol. Biol. Evol. 23 (10): 1922–30. doi:10.1093/molbev/msl055. PMID 16829542.

[8] Burki, Fabien; Roger, Andrew J.; Brown, Matthew W.; Simpson, Alastair G. B. (2020-01-01). "The New Tree of Eukaryotes". Trends in Ecology & Evolution. 35 (1): 43–55. doi:10.1016/j.tree.2019.08.008  . ISSN 0169-5347. PMID 31606140.

[Brown_2018-9] Brown, Matthew W.; Heiss, Aaron A.; Kamikawa, Ryoma; Inagaki, Yuji; Yabuki, Akinori; Tice, Alexander K; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-Ichiro; Hashimoto, Tetsuo; Simpson, Alastair; Roger, Andrew (2018-01-19). "Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super-Group". Genome Biology and Evolution. 10 (2): 427–433. doi:10.1093/gbe/evy014. PMC 5793813  . PMID 29360967.

[Picozoa_2021-10] Schön ME, Zlatogursky VV, Singh RP, et al. (2021). "Picozoa are archaeplastids without plastid". Nature Communications. 12 (1): 6651. bioRxiv 10.1101/2021.04.14.439778  Periksa nilai |biorxiv= (bantuan). doi:10.1038/s41467-021-26918-0. PMC 8599508  Periksa nilai |pmc= (bantuan). PMID 34789758 Periksa nilai |pmid= (bantuan).

[Provora_2022-11] Tikhonenkov DV, Mikhailov KV, Gawryluk RM, et al. (December 2022). "Microbial predators form a new supergroup of eukaryotes". Nature. 612 (7941): 714–719. doi:10.1038/s41586-022-05511-5. PMID 36477531 Periksa nilai |pmid= (bantuan).

[Burki_Roger_Brown_Simpson_2020_pp._43–55-12] Burki, Fabien; Roger, Andrew J.; Brown, Matthew W.; Simpson, Alastair G.B. (2020). "The New Tree of Eukaryotes". Trends in Ecology & Evolution. Elsevier BV. 35 (1): 43–55. doi:10.1016/j.tree.2019.08.008  . ISSN 0169-5347. PMID 31606140.

[1]

[2]

[4]

[3]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]